Sự khác biệt giữa genotyping và trình tự sắp xếp | Genotyping và Sequencing
Sự khác biệt chính - Genotyping và Sequencing
Genotyping và sequencing là hai kỹ thuật được thực hiện để có được thông tin về các axit nucleic, chủ yếu là DNA của cơ thể. Sự khác biệt chính giữa genotyping và sequencing là việc phân loại gen là quá trình xác định biến thể di truyền nào mà cá thể sở hữu bằng cách sử dụng các dấu hiệu trong khi trình tự sắp xếp là sự xác định thứ tự đúng của trình tự nucleotide bên trong một đoạn DNA.
NỘI DUNG
1. Tổng quan và Chênh lệch khác nhau
2. Genotyping là gì
3. Trình tự nối tiếp là gì
4. So sánh Side by Side - Genotyping và Sequencing
5. Tóm tắt
Genotyping là gì?
Genotyping là sự xác định tính chất di truyền của một cá nhân sử dụng một dãy DNA và các marker, so sánh và xác định sự thừa kế của nó. Genotyping rất quan trọng trong sinh học tiến hoá, sinh học quần thể, phân loại, sinh thái và gen di truyền của sinh vật. Nó có thể được thực hiện bằng các kỹ thuật khác nhau bao gồm trình tự DNA, phản ứng chuỗi polymerase, sự đa hình chiều dài đoạn cắt giảm (RFLP), sự phát hiện đa hình ngẫu nhiên khuếch đại, sự đa hình độ dài đoạn mã khuyếch đại (AFLP), các máy vi tính DNA, …
Genotyping liên quan đến trình tự các đoạn DNA nhỏ đặc biệt và tìm kiếm mối quan hệ liên quan của thành phần di truyền với các cá thể khác sử dụng các marker di truyền. Nó xác định các đa hình nucleotide đơn (SNPs) giữa các cá nhân hoặc các allele cụ thể. Genotyping được áp dụng cho một loạt các sinh vật bao gồm cả con người. Nó cũng có thể áp dụng cho các vi sinh vật như virus, nấm vv và có thể được sử dụng để xác định các biến thể di truyền của chúng với các hồ sơ tham khảo. Trong dịch tễ học phân tử và vi sinh vật học, kiểm soát các mầm bệnh, đặc biệt là vi sinh vật, được thực hiện bằng các thông tin thu được từ genotyping. Genotyping rất quan trọng trong phân tích phả hệ. Con người được tạo gen để xác nhận làm mẹ và làm cha. Genotype sẽ tiết lộ các allel chiếm ưu thế và suy thoái của các gen quyết định các đặc tính cụ thể.
Hình 1: RFLP Genotyping
Trình tự sắp xếp là gì?
Trình tự là trình tự xác định trật tự chính xác của nucleotide trong một đoạn DNA hoặc RNA nhất định. Hầu như tất cả các thông tin cần thiết cho sự tăng trưởng và phát triển của một cơ thể được mã hoá trong bộ gen của nó. Sự sẵn có của kỹ thuật để sản xuất và tách ra một vài trăm nucleotide đoạn mã nucleic dài đã dẫn đến sự phát triển của các thủ tục xác định trình tự nucleotide chính xác của một đoạn DNA hoặc RNA nhất định.Các loại phương pháp lập trình khác nhau hiện có ngày hôm nay. Các phương pháp sắp xếp này, cùng với công nghệ xây dựng các thư viện bộ gen đại diện cho toàn thể bộ gen của cơ thể, tạo điều kiện cho việc sắp xếp toàn bộ bộ gen của sinh vật đó, phân tích sâu về cấu trúc gen, các chức năng gen, vị trí gen, biểu hiện gen, lập bản đồ gen, các vùng điều chỉnh gen …
Tổng số bộ gen của nhiều loại virut, một số vi khuẩn, archaebacteria, men và một số sinh vật khác đã được sắp xếp và lập bản đồ. Dự án bộ gen con người đã làm cho nó có thể sắp xếp và lập bản đồ bộ gen của con người và công bố bản thảo đầu tiên vào năm 2003. Đó là một cột mốc quan trọng trong sự tiến bộ của sinh học. Các trình tự bộ gen của con người hiện nay được sử dụng trong ngành y tế để xác định các nguyên nhân di truyền đối với các bệnh hiếm gặp, nguy cơ bệnh về màn hình ở trẻ sơ sinh, xác định các chi tiết về di truyền của các loại ung thư khác nhau, phát triển các phương pháp điều trị mới và phát triển các công cụ chẩn đoán mới …, genome lúa và bộ gen Arabidopsis đã được sắp xếp. Kiến thức về những trình tự này chắc chắn sẽ cách mạng hóa sự hiểu biết của chúng ta về cách tế bào và các sinh vật hoạt động.
Hình 2: Một phép tự động phân tích trình tự sanger
Sự khác biệt giữa Genotyping và Sequencing là gì?
- khác
Genotyping và Sequencing |
|
| Genotyping là quá trình xác định thành phần di truyền của một cá nhân và kiểm tra nhóm hoặc phân loại của sinh vật đó. | Trình tự là trình tự xác định trình tự chính xác của các nucleotide của một đoạn ADN hoặc RNA nhất định. |
| Kỹ thuật | |
| RFLP, Trình tự gen, PCR, DNA microarrays, AFLP, vv | Trình tự Sanger, Gilbert sắp xếp, Pyrosequencing, Next Generation Sequencing, Xử lý Shotgun vv |
| Mối quan tâm lớn | |
| quan tâm đến việc liệu sự khác biệt kiểu gen có tạo ra sự khác biệt kiểu hình thực sự hay không. | Điều này quan tâm hơn đến trình tự của nucleotide và sự khác biệt và sự thay đổi của nó với các sinh vật khác. |
Tóm tắt - Genotyping và Sequencing
Genotyping và trình tự sắp xếp là rất hữu ích để nghiên cứu thông tin di truyền của các sinh vật. Genotyping là quá trình xác định các biến thể kiểu gen giữa các cá nhân và tìm kiếm các loại của chúng. Trình tự là quá trình xác định trật tự chính xác của các nucleotide trong đoạn quan tâm hoặc vùng DNA. Cả hai kỹ thuật đều cung cấp thông tin quan trọng về gen và bộ gen.
Tài liệu tham khảo:
1. "Phương pháp genotyping. "Các phương pháp trong sinh học phân tử (Clifton, N.J.). U. S. Thư viện Y khoa Quốc gia, n. d. Web. 20 tháng 2 năm 2017.
2. Akey, J. M., D. Sosnoski, E. Parra, S. Dios, K. Heister, B. Su, C. Bonilla, L. Jin và M. D. Shriver. "Phân tích đường cong nóng chảy của SNP (McSNP ): Một cách tiếp cận không chứa gel và không tốn kém cho SNP Genotyping. "Kỹ thuật sinh học 30. 2 (2001): 358-67. Web.
Hình ảnh Courtesy:
1. "RFLP genotyping" Bởi (không rõ) - Viện Y tế Quốc gia (Public Domain) qua Commons Wikimedia
2."Radioactive Fluorescent" của Abizar tại Wikipedia tiếng Anh (CC BY-SA 3. 0) thông qua Commons Wikimedia
