Sự khác biệt giữa Benzonase và DNase | Benzonase so với DNase

Anonim

Key Sự khác biệt - Benzonase với DNase

Sự thoái hóa axit nucleic rất quan trọng đối với nhiều kỹ thuật sinh học phân tử. Nó được sử dụng rộng rãi trong công nghệ tái tổ hợp DNA để loại bỏ các đoạn DNA và RNA không mong muốn. Enzyme phân huỷ axit nucleic được gọi là các hạt nhân, và chúng có thể có các loại khác nhau dựa trên các chức năng cần thiết. Các hạt nhân làm suy thoái DNA được gọi là DNases trong khi những hạt phân huỷ RNA được biết là RNases. Các enzyme này chủ yếu được sử dụng trong các thí nghiệm trong ống nghiệm ở đó trong các thử nghiệm phân tử vitro được thực hiện để cô lập DNA, RNA hoặc protein hoàn toàn. Benzonase là một loại hạt nhân làm suy giảm cả DNA và RNA trong khi DNases làm suy giảm chỉ DNA. Đây là điểm khác biệt chính giữa Benzonase và DNase.

NỘI DUNG

1. Tổng quan và Chênh lệch khác nhau

2. Benzonase là gì

3. DNase là gì

4. Tương tự giữa Benzonase và DNase

5. So sánh Side by Side - Benzonase so với DNase ở dạng Tables 6. Tóm tắt

Benzonase là gì?

Benzonase là một endonuclease được biến đổi di truyền từ

Serratia marcescens

. Enzym này được sản xuất trong E. coli ở quy mô công nghiệp. Benzonase có khả năng phân tách ADN kép, DNA tuyến tính, ADN vòng và RNA đơn. Vì vậy Benzonase là thương mại quan trọng. Benzonase enzym là một dimer protein có 245 axit amin giống hệt nhau, ~ 30 kDa tiểu đơn vị với hai liên kết disulfide thiết yếu. Benzonase tách axit nucleic ở đầu 5 'của nó và kết quả trong các mảnh với miễn phí 5'. Benzonase có thể tách axit nucleic ở bất kỳ chuỗi nào nhưng thích các vùng giàu GC.

Benzonase được lưu trữ ở -20

0

C. PH tối ưu cho hoạt động của enzim là 8. 0 - 9. 2. Các ứng dụng của Benzonase bao gồm việc chuẩn bị mẫu cho điện di gel protein 2D, trong đó Benzonase loại bỏ các axit nucleic bị ràng buộc và loại bỏ các chất gây ô nhiễm axit nucleic từ các chế phẩm protein tái tổ hợp. Nó cũng được sử dụng để làm giảm độ nhớt của chiết xuất từ ​​protein và ngăn ngừa sự kết tụ tế bào trong hỗn hợp tế bào.

DNase là gì?

DNase là một enzyme nuclease, thủy phân chỉ có khả năng tách DNA hai mặt. Có hai loại DNase chính: DNase I và DNase II. DNase Tôi tham gia vào việc tách DNA kép để tạo các polynucleotides với 5 'kết thúc miễn phí. DNase II liên quan đến việc tách DNA hai mặt để tạo ra các sợi polynucleotide với 3 'đầu hoặc cuối nhô ra ngoài.

DNase I

DNase I hoạt động ở độ pH tối ưu giữa 7 0 - 8. 0. Hoạt động của enzim phụ thuộc vào nhiều đồng phân ion bao gồm Ca 2+ Mg

2 +

hoặc Mn 2+ . Các hoạt động của Mg 2+ và Mn 2+ quyết định chức năng của DNase I. Với sự hiện diện của Mg 2+ , DNase I tách ra mỗi sợi dsDNA độc lập. Điều này diễn ra một cách ngẫu nhiên. Ngược lại, với sự có mặt của Mn 2+, enzyme cắt cả hai dải DNA ở cùng vị trí. Sự phân tách này sẽ tạo ra hai loại đoạn DNA; một loại với đầu cùn và một loại khác với một hoặc hai nhô lên các nucleotide. Hình 2: DNase DNase II DNase II có chức năng ở pH tối ưu là 4,5-5. 0 và ion kim loại hóa trị hai là cần thiết cho hoạt động của nó, tương tự như DNase I. Cơ chế của DNase II được biết là bao gồm ba bước chính. Nhiều phá vỡ sợi đơn được gây ra trong xương sống DNA.

Các nucleotide hòa tan trong axit và oligonucleotides được sản xuất.

Sự thay đổi cường sắc phi tuyến tính diễn ra trong giai đoạn cuối.

Các chất ức chế chính của enzyme DNase bao gồm các chất chelat kim loại, các kim loại chuyển tiếp và các hóa chất như Sodium dodecyl sulfate và β - mercaptoethanol.

  1. Các ứng dụng chính của DNase bao gồm việc chuẩn bị các chiết RNA không chứa DNA và chiết xuất protein và loại bỏ mẫu DNA trong các thí nghiệm phiên mã in vitro.
  2. Những điểm tương đồng giữa Benzonase và DNase là gì?
  3. Cả hai đều là các enzyme thủy phân.

Cả hai đều là các hạt nhân.

Cả hai đều tham gia bằng cách cắt các liên kết phosphodiester của các axit nucleic.

Cả hai đều yêu cầu pH tối ưu và nhiệt độ bảo quản để duy trì hoạt động của enzyme.

  • Các chất ức chế enzyme bao gồm các chất chelating, các kim loại chuyển tiếp và các chất tẩy rửa.
  • Các ứng dụng chủ yếu tập trung vào việc thu thập các chiết xuất độ tinh khiết cao của DNA, RNA và protein.
  • Cả hai enzyme đều có thể được tạo ra thông qua kỹ thuật di truyền.
  • Khác biệt giữa Benzonase và DNase là gì?
  • - Điều khác biệt giữa Bảng trước ->
  • Benzonase vs DNase
  • Benzonase là một enzyme có khả năng tách DNA, DNA tuyến tính, DNA vòng, và RNA.

DNase là một enzyme có khả năng tách DNA hai mặt.

Chất liệu cho Enzyme

Cả DNA và RNA đều là chất nền cho benzonase.

DNA là chất nền cho DNase. Cấu trúc
Khoảng pH tối ưu của Benzonase là 7. 0 -8. 0
Khoảng pH tối ưu của DNase I là 7. 0 - 8. 0 và DNase II là 4. 5 - 5. 0. Tóm tắt - Benzonase và DNase
Các enzyme Nuclease được sử dụng rộng rãi trong các thí nghiệm khác nhau liên quan đến sinh học phân tử và kỹ thuật di truyền. Benzonase và DNase là hai loại hạt nhân. Benzonase có liên quan đến phân hủy cả DNA và RNA trong khi đó DNase tham gia vào việc tách DNA hai dây. Đây là sự khác biệt cơ bản giữa benzonase và DNase. Hiện tại, cả hai loại nuclease này đều được tạo ra nhờ công nghệ DNA tái tổ hợp tạo ra các enzym chất lượng cao hơn được tối ưu hóa cho sản xuất tối đa.
Tải xuống phiên bản PDF của Benzonase và DNase Bạn có thể tải xuống phiên bản PDF của bài viết này và sử dụng nó cho các mục đích ngoại tuyến theo lưu ý. Vui lòng tải xuống ở đây PDF version Sự khác nhau giữa Benzonase và DNase

Tài liệu tham khảo:

1. "Deoxyribonuclease tôi từ tuyến tụy d5050. "Sigma-Aldrich, Có ở đây. Truy cập vào 19 Tháng 9 năm 2017.

2. "Deoxyribonuclease II. "Deoxyribonuclease II - Hướng dẫn Enzyme Worthington, có tại đây. Đã truy cập vào ngày 19 tháng 9 năm 2017.

Hình ảnh Nhã nhảnh:

1. "Vị trí quá nhạy cảm DNAse" Theo Wang Y-M, Zhou P, Wang L-Y, Li Z-H, Zhang Y-N, et al. - Wang Y-M, Zhou P, Wang L-Y, Li Z-H, Zhang Y-N, et al. (2012) Sự tương quan giữa DNase I Phân bố trang web nhạy cảm và biểu hiện gen trong các tế bào HeLa S3. PLoS ONE 7 (8): e42414. doi: 10.1371 / tạp chí. pone. 0042414 (CC BY-SA 2. 5) thông qua Commons Wikimedia