Sự khác biệt giữa AFLP và RFLP | AFLP vs RFLP

Anonim

Sự khác biệt chính - AFLP và RFLP

Các nghiên cứu DNA có tầm quan trọng to lớn trong việc hiểu và xác định các mối quan hệ phát sinh loài, chẩn đoán các bệnh di truyền và các bộ gen của cơ thể lập bản đồ. Một số kỹ thuật liên quan đến phân tích DNA cũng được sử dụng để xác định một gen cụ thể hoặc một dãy DNA trong một bể DNA chưa biết. Chúng được gọi là các dấu phân tử. (RFLP) là hai marker phân tử (các phương pháp) phân tử như vậy được phát triển trong sinh học phân tử để phát hiện sự biến đổi di truyền giữa các sinh vật. Cả hai phương pháp đều quan trọng không kém và có lợi thế và bất lợi. Sự khác biệt chính giữa AFLP và RFLP là AFLP liên quan đến sự khuếch đại PCR khuyếch đại được chọn lọc trong khi RFLP không liên quan đến chọn lọc PCR khuếch đại các đoạn DNA. NỘI DUNG 1. Tổng quan và Chênh lệch khác nhau 2. AFLP là gì

3. RFLP là gì

4. So sánh Side by Side - AFLP vs RFLP

5. Tóm tắt

AFLP là gì?

AFLP (Phép đa hình Chiều dài Phân mảnh) là một công cụ quan trọng trong sinh học phân tử và được sử dụng rộng rãi trong phân tích biến dị di truyền. AFLP dựa trên sự khuếch đại PCR cụ thể của ADN di truyền phân đoạn và phát hiện đa hình bằng các phép tự động thông qua điện di gel. AFLP đóng góp rất nhiều vào việc xác định sự khác biệt di truyền trong các dòng dõi hoặc các loài liên quan chặt chẽ đến các vương quốc khác nhau bao gồm thực vật, động vật, vi khuẩn và nấm. AFLP có thể được thực hiện với một lượng nhỏ các mẫu DNA không rõ. Nó không đòi hỏi kiến ​​thức trình tự trước và thiết kế đầu dò.

Các bước của sự phân tách DNA của AFLP

Sự phá hủy DNA với endonucleases hạn chế

Ligation các đoạn ADN hạn chế với các adapter

Sự khuếch đại chọn lọc các đoạn với sự hạn chế cụ thể Các trang web

Sự tách biệt các sản phẩm PCR bằng phương pháp điện di gel> AFLP là một phương pháp dễ phân biệt hơn và có khả năng tái tạo có thể được sử dụng trong quá trình hình thành DNA của một số taxa bao gồm nấm, vi khuẩn, thực vật và động vật mà không có kiến ​​thức về trình tự DNA. Nó giúp xác định những khác biệt nhỏ giữa các cá nhân trong quần thể do tính chất nhạy cảm cao của nó. AFLP cũng rất quan trọng trong việc lập bản đồ gen, nghiên cứu pháp y, kiểm tra của phụ huynh, genotyping, vv

  1. Hình 01: AFLP
  2. RFLP là gì?
  3. Hạn chế Độ dài Chiều dài Đa hình (RFLPs) là một kỹ thuật được sử dụng để phát hiện các biến thể di truyền trong các trình tự DNA tương đồng.Đây là phương pháp đầu tiên được phát triển để làm hồ sơ DNA. Các sinh vật có dấu vân tay DNA hoặc hồ sơ DNA. RFLP đóng vai trò như một công cụ quan trọng để phân tích sự biến thiên giữa các cấu tử DNA của các sinh vật trong hoặc liên quan chặt chẽ vì các trình tự tương đồng có các vị trí hạn chế khác nhau (vị trí) độc nhất với một cơ thể cụ thể. Khi DNA tương đồng được tiêu hóa bằng các endonucleases hạn chế cụ thể, nó sẽ tạo ra các cấu trúc DNA khác nhau độc đáo cho từng cá thể. Do đó, hiệu trưởng của phương pháp này là phát hiện sự biến đổi di truyền giữa các sinh vật bằng cách hạn chế DNA tương đồng với các enzyme hạn chế cụ thể và phân tích đa hình chiều dài đoạn thông qua điện di gel và blotting. Các mô hình thấm thấu là duy nhất cho mỗi sinh vật và đặc trưng cho các kiểu gen cụ thể.
  4. Các bước của RFLP
  5. Phân lập đủ số lượng ADN từ các mẫu
  6. Sự phân mảnh của các mẫu DNA với các endonucleases hạn chế cụ thể vào đoạn ngắn

Sự tách các đoạn kết quả với các độ dài khác nhau bằng phương pháp điện di agarose gel.

Chuyển hồ sơ gel thành màng nhờ phương pháp Southern blotting

Hybridization của màng với các đầu dò nhãn và phân tích chiều dài đa đoạn đoạn trong mỗi profile

RFLP là một kỹ thuật rất quan trọng trong việc phát hiện sự thừa bệnh và tìm ra nguy cơ mắc bệnh trong gia đình. RFLP cũng thường được sử dụng trong lập bản đồ gen, xác định tội phạm trong các trường hợp pháp lý, xét nghiệm quan hệ cha con … RFLP cũng có một số hạn chế. RFLP yêu cầu kiến ​​thức về dữ liệu trình tự để thiết kế đầu dò cho lai. Nó cũng đòi hỏi phải phân lập đủ số lượng DNA từ mẫu để phân tích, điều này rất khó khăn trong các nghiên cứu pháp y.

Hình 01: Bản đồ RRFLP

Sự khác nhau giữa AFLP và RFLP là gì?

  1. Điều khác biệt giữa Bảng trước ->
  2. ALFP vs RFLP
  3. AFLP liên quan đến sự khuếch đại chọn lọc PCR của DNA bị tiêu hóa.
  4. RFLP không liên quan đến PCR trừ khi nó là PCR-RFLP.
  5. Kiến thức trình tự

Kiến thức trình tự trước không bắt buộc.

Cần phải có kiến ​​thức trình tự trước để thiết kế đầu dò RFLP.

Độ tin cậy

Điều này đáng tin cậy hơn.

Điều này ít đáng tin cậy hơn so với AFLP.

Hiệu quả trong việc phát hiện sự đa hình Điều này có hiệu quả cao hơn trong việc phát hiện đa hình hơn RFLP.
Điều này kém hiệu quả so với AFLP.
Chi phí Đây là một ít tốn kém so với RFLP.
Đây là chi phí ít hơn so với AFLP.
Các ứng dụng AFLPs đã được áp dụng cho việc lập bản đồ gen, DNA fingerprinting, nghiên cứu đa dạng di truyền, xét nghiệm quan hệ cha con và pháp y
Phân tích RFLP là một công cụ quan trọng trong lập bản đồ gen, địa hoá các gen di truyền rối loạn, xác định nguy cơ bệnh tật và xét nghiệm quan hệ cha con.
Tóm lược - AFLP và RFLP AFLP và RFLP là hai kỹ thuật được sử dụng như các marker di truyền để đánh giá sự đa dạng và đánh giá các mối quan hệ di truyền trong sinh học phân tử.AFLP phục vụ như là một phương pháp hiệu quả và nhạy cảm để phát hiện đa hình gen giữa các sinh vật so với RFLP. Tuy nhiên, mặc dù cả hai phương pháp này có hiệu quả khác nhau trong việc phát hiện các biến thể di truyền, chúng vẫn được sử dụng để chẩn đoán DNA và vân tay.
Tài liệu tham khảo:
'1. Garcia, Antonio A. F., Luciana L. Benchimol, Antônia M. M. Barbosa, Isaias O. Geraldi, Souza Jr. Cláudio L., và Anete P. De Souza. "So sánh các dấu hiệu RAPD, RFLP, AFLP và SSR cho các nghiên cứu đa dạng trong các dòng lai thuần. "Di truyền học và Sinh học phân tử. Sociedade Brasileira de Genética, 2004. Web. 19 tháng 3 năm 2017 2. "Hạn chế Sự phân mảnh Chiều dài Đa dạng (RFLP). "Trung tâm Thông tin Công nghệ Sinh học Quốc gia. U. S. Thư viện Y khoa Quốc gia, n. d. Web. 19 tháng 3 năm 2017
3. Masiga D.K và Turner C.M (2004). "Phân tích đa dạng chiều dài đoạn (Amplified) (hạn chế) (AFLP)". Phương pháp Mol Biol: 270: 173-86. NCBI. Web. 19 tháng 3 năm 2017
Hình ảnh được phép bởi: 1. "ALFP" Bởi Barbarossa tại Wikipedia tiếng Hà Lan - Chuyển từ nl. wikipedia để Commons. (Tên miền công cộng) thông qua Commons Wikimedia

2. "Lập bản đồ RFLP" của Retama - Tác phẩm của chính mình (GFDL) qua Commons Wikimedia