Sự khác biệt giữa dịch thuật Nick và mở rộng lớp sơn lót | Dịch thuật Nick & Primer Extension

Anonim

Sự khác biệt chính - Dịch thuật Nick và Primer Extension

Nick translation và primer extension là hai kỹ thuật quan trọng được thực hiện trong sinh học phân tử. Sự khác biệt quan trọng giữa bản dịch nick và việc mở rộng mồi là quá trình phiên dịch nick labes cho các kỹ thuật lai khác trong khi phương pháp mở rộng mồi cố định nhận dạng một trình tự RNA cụ thể từ một hỗn hợp và tiết lộ thông tin về biểu hiện mRNA. Cả hai kỹ thuật đều có tầm quan trọng rất lớn và được thực hiện thường xuyên trong phòng thí nghiệm nghiên cứu phân tử.

NỘI DUNG

1. Tổng quan và Chênh lệch khác nhau

2. Dịch Nick là gì

3. Tuổi thọ móng là gì

4. So sánh Side by Side - Dịch thuật Nick & Primer Extension

5. Tóm tắt

Dịch Nick là gì?

Dịch Nick là một kỹ thuật quan trọng được sử dụng để chuẩn bị các đầu dò có nhãn hiệu cho các kỹ thuật sinh học phân tử khác nhau như blotting, lai tạo tại chỗ 999, lai tạo huỳnh quang 999 tại chỗ 999. Nó là in vitro phương pháp ghi nhãn DNA. Đầu dò DNA được sử dụng để xác định trình tự ADN hoặc RNA cụ thể. Với sự trợ giúp của một đầu dò ghi nhãn, các mảnh cụ thể có thể được đánh dấu hoặc hình dung từ một hỗn hợp axit nucleic. Do đó, các đầu dò nhãn được chuẩn bị bằng cách sử dụng các kỹ thuật khác nhau để sử dụng cho các kỹ thuật khác nhau. Dịch thuật Nick là một trong những phương pháp đó tạo ra các máy dò nhãn với sự trợ giúp của các enzyme DNase 1 và DNA polymerase 1.

Quá trình dịch nick bắt đầu với hoạt động enzyme DNase 1. DNase 1 giới thiệu nicks trong phosphate xương sống của ADN kép bằng cách cắt các liên kết phosphodiester giữa các nucleotide. Một khi nick được tạo ra miễn phí 3 'nhóm OH của nucleotide sẽ được mang lại và enzyme DNA polymerase 1 sẽ tác động lên nó. Hoạt động của exonuclease từ 5 'đến 3' của DNA polymerase 1 loại bỏ các nucleotide khỏi nick đối với hướng 3 'của sợi DNA. Đồng thời, hoạt tính polymerase của enzyme DNA polymerase 1 hoạt động và thêm các nucleotide để thay thế các nucleotide đã được loại bỏ. Nếu các nucleotide được dán nhãn, sự thay thế sẽ xảy ra bởi các nucleotide đã dán nhãn và nó sẽ đánh dấu DNA để xác định. DNA được gắn nhãn mới này có thể được sử dụng làm đầu dò trong các phản ứng lai khác nhau trong Sinh học phân tử.
Hình 01: Quá trình dịch Nick Mở rộng của Primer là gì?

Mở rộng mồi là một kỹ thuật được sử dụng để tìm trình tự RNA cụ thể từ một hỗn hợp RNA và xác định đoạn cuối của mRNA 5 '. Nó cũng được sử dụng để nghiên cứu cấu trúc RNA và biểu hiện. Phương pháp kéo dài mồi được thực hiện với mồi có gắn nhãn hoặc với các nucleotide được dán nhãn. Nếu sử dụng mồi được dán nhãn, nó loại trừ nhu cầu gắn nhãn các nucleotide được sử dụng để tổng hợp cDNA. Có một số bước trong kỹ thuật này. Nó bắt đầu bằng việc chiết RNA từ mẫu. Sau đó, một mồi oligonucleotide dán nhãn được thêm vào hỗn hợp cùng với các thành phần cần thiết để tổng hợp cDNA của một trình tự RNA cụ thể. Primer anneals với chuỗi bổ sung từ hỗn hợp. Sử dụng chuỗi mồi được làm mồi như khuôn mẫu, men sao chép ngược tổng hợp DNA bổ sung (cDNA) của chuỗi RNA. Sự nảy mồi và dịch mã ngược sao chép xảy ra chỉ khi trình tự RNA cụ thể có mặt trong mẫu. Cuối cùng, khi quá trình điện di gel hóa được thực hiện, kích cỡ của chuỗi RNA có thể được xác định. Cũng dễ dàng tìm thấy cơ sở +1 của dãy mRNA (trình tự phiên mã sao mã) theo phương pháp mở rộng mồi. Số lượng mRNA có trong mẫu có thể được định lượng bằng phương pháp này nếu sơn lót thừa được sử dụng.

Hình 2: Sự mở rộng của lớp sơn lót

Sự khác nhau giữa dịch thuật Nick và phần mở rộng lớp sơn lót là gì?

- Khác biệt giữa bài báo trước khi bàn ->

Dịch thuật Nick & Primer Extension

Dịch thuật Nick là một quá trình tạo ra các máy dò DNA có gắn nhãn cho các phản ứng lai khác nhau.

Mở rộng mồi là một kỹ thuật được sử dụng để tìm RNA cụ thể hoặc nghiên cứu biểu hiện gen.

Enzyme Được sử dụng

DNase 1 và enzyme DNA polymerase được sử dụng.

Enzyme sao chép ngược được sử dụng.

Tầm quan trọng Bản dịch Nick tạo điều kiện cho việc đánh dấu trình tự DNA cụ thể.
Phần mở rộng của Primer cho phép phát hiện kích thước mRNA cụ thể và số lượng có trong mẫu.
Tóm lược dịch - Nick Translation & Primer Extension Dịch thuật Nick là một phương pháp được sử dụng để tổng hợp các đầu dò được ghi nhãn dựa trên các hoạt động của enzyme DNA polymerase 1 của DNA DNase 1 và
E coli DNA 9. Đó là một phương pháp
in vitro được sử dụng trong phòng thí nghiệm trước khi áp dụng kỹ thuật lai ghép khác nhau. Trong quá trình dịch nick, hoạt động của exonuclease 5'-3 'của DNA polymerase 1 loại bỏ các nucleotide trước hoạt động của nick và polymerase của DNA polymerase 1 thay thế các nucleotide đã được loại bỏ với các nucleotide được dán nhãn phía sau nick. Primer extension là một phương pháp được sử dụng để phát hiện một bản ghi RNA cụ thể từ một hỗn hợp và định lượng kích thước và lượng RNA quan tâm. Đây là sự khác biệt giữa dịch nick và mồi.

Tài liệu tham khảo

1. Reid, Alex. "Dịch Nick. "Springer. N. p., n. d. Web. 18 tháng 4 năm 2017 2. "Mở rộng mồi. "Chẩn đoán Toàn quốc. N. p., n. d. Web. 19 tháng 4 năm 2017 3. Kuo, M. T., và W. Plunkett."Nick dịch các nhiễm sắc thể metaphase: in vitro ghi nhãn của các vùng nhạy cảm nuclease trong nhiễm sắc thể. "Thủ tục của Học viện Khoa học Quốc gia Hoa Kỳ. U. S. Thư viện Y học Quốc gia, tháng 2 năm 1985. Web. 19 tháng 4 năm 2017 4. Raymond và cộng sự "Thử nghiệm PCR đơn giản và định lượng để kiểm tra trực tiếp microRNAs và RNA nhiễu ngắn. "RNA. Bản quyền 2005 của RNA Society, tháng 11 năm 2005. Web. Ngày 19 tháng 4 năm 2017 Hình ảnh Nhã nhảnh:

1. "Primer Extension Assay" Tác giả Jjnmmnjj - Tác phẩm của chính mình (CC BY-SA 3. 0) qua Commons Wikimedia