Sự khác biệt giữa Exome và Transcriptome | Exome vs Transcriptome

Anonim

Sự khác biệt chính - Ngoại trừ với Transcriptome

Một gen chứa các vùng mã hoá và không mã hóa bên trong nó. Các chuỗi mã được gọi là exon, và chuỗi không mã hóa được gọi là intron. Trình tự nucleotide của exon của một gen đại diện cho mã di truyền của gen để tổng hợp các protein cụ thể. Do đó, exon vẫn còn trong phân tử mRNA. Tổng diện tích exon của bộ gen được gọi là exome, và nó là một phần quan trọng của hệ gen. Mã di truyền của các gen được chuyển thành mã di truyền của phân tử mRNA, cần thiết cho việc sản xuất protein. Toàn bộ các phân tử mRNA được sao chép trong tế bào hoặc một quần thể tế bào tại một thời điểm được biết đến như một bản sao. Sự khác biệt chính giữa các ví dụ và phiên mã là

xuất hiện đại diện cho các trình tự của các vùng exon của bộ gen trong khi trình tự đại diện cho tổng mRNA của tế bào hoặc mô ở một thời điểm nhất định.

NỘI DUNG

1. Tổng quan và Chênh lệch khác nhau

2. Exome là gì

3. Transcriptome là gì

4. So sánh Side by Side - Exome vs Transcriptome

5. Tóm tắt

Exome là gì?

Gen bao gồm exon, introns và các trình tự điều tiết. Exons là các vùng gen được chuyển mã thành chuỗi mRNA trong quá trình phiên mã. Intron và các vùng không mã hóa khác sẽ bị xóa trong quá trình sao chép. Trình tự nucleotide của exon xác định mã di truyền của gen tổng hợp các protein cụ thể mà nó mã hoá. Chỉ exon duy trì trong mRNA của một protein. Bộ sưu tập của exon trong bộ gen được biết đến như là một phần của một sinh vật. Nó đại diện cho một phần của bộ gen được biểu hiện bằng gien. Ở người, các số liệu xuất hiện 1% từ hệ gen. Đây là phần mã hóa protein của hệ gen người.

Hình 1: Xuất hiện

Bản sao là gì?

Bản sao là bộ sưu tập của tất cả các bản ghi mã hóa protein và không mã hóa (RNA) trong một mô nhất định. Transcriptome đại diện cho bộ sưu tập của các phân tử mRNA tổng thể biểu hiện bởi các gen trong một tế bào hoặc một mô. Các phiên mã của một tế bào có thể được thay đổi với các phiên mã của một loại tế bào khác. Các bản sao cũng năng động - nó thay đổi theo thời gian để đáp ứng với cả kích thích bên trong và bên ngoài. Ngay cả trong cùng mô hoặc trong cùng một kiểu tế bào, phiên mã có thể thay đổi sau vài phút.

Bản mô tả khác với các sinh vật có trong thực vật. Transcriptome chỉ bao gồm các trình tự exome thể hiện.Mặc dù tế bào của một tế bào vẫn giữ nguyên, sự sao chép khác nhau giữa các tế bào vì biểu hiện gen không giống nhau cho tất cả các tế bào hoặc các mô. Chỉ có các gen thiết yếu được biểu hiện trong các tế bào và mô khác nhau. Biểu hiện gen là một quá trình mô tế bào hoặc tế bào cụ thể. Nó được điều chỉnh bởi các yếu tố khác nhau bao gồm các yếu tố môi trường. Do đó, phiên mã có thể thay đổi theo điều kiện môi trường bên ngoài.

Transcriptome được sử dụng làm tiền thân cho các nghiên cứu về proteomics. Tất cả các protein đều có nguồn gốc từ chuỗi mRNA. Các sửa đổi về ngôn ngữ có thể dẫn đến sự thay đổi protein. Tuy nhiên, bản sao cung cấp thông tin cơ bản quan trọng cho các nghiên cứu proteomic.

Hình 2: Bản sao của tế bào gốc phôi

Khác biệt giữa Exome và Transcriptome là gì?

- Khác với bài báo ở giữa trước khi bàn ->

Exome hay Transcriptome

Exome là bộ sưu tập các vùng mã hóa protein của các gen.

Transcriptome là bộ sưu tập của tất cả các ARN được phiên mã bao gồm mRNA. Mẫu
Exome được nghiên cứu sử dụng mẫu DNA.
Transcriptome được nghiên cứu bằng cách sử dụng một mẫu RNA. Phương pháp nghiên cứu
Toàn bộ trình tự exome là phương pháp nghiên cứu exome.
RNA sequencing là phương pháp nghiên cứu phiên mã. Tóm tắt - Exome so với Transcriptome

Exons là chuỗi mã hóa của các gen và xác định trình tự mRNA của protein. Bộ sưu tập của các chuỗi mã (exons) được biết đến như là một phần của một sinh vật. Gen được chuyển mã thành các phân tử mRNA trước khi tạo ra các protein. Các phân tử mRNA tổng số của một tế bào hoặc một mô ở bất kỳ thời điểm nào được biết đến như là phiên mã. Transcriptome đại diện cho các gen đang được tích cực thể hiện thành mRNA tại bất kỳ thời điểm nào. Transcriptome là tế bào và mô cụ thể và ảnh hưởng với điều kiện môi trường. Đây là sự khác biệt giữa các ví dụ và chuyển ngữ.

Tài liệu tham khảo:

1. Sarah và các cộng sự, "Nhắm mục tiêu bắt giữ và sắp xếp chuỗi song song của mười hai thu nhập của con người. " Thiên nhiên. U. S. Thư viện Y học Quốc gia, ngày 10 tháng 9 năm 2009. Web. 01 tháng 4 năm 2017

2. Mutz et al. "Phân tích transcriptome sử dụng trình tự thế hệ tiếp theo. "Elsevier: Vị trí Điều. N. p., Tháng 9 năm 2012. Web. 01 tháng 4 năm 2017

Hình ảnh được phép bởi:

1. "Bản sao của các tế bào đa năng" Theo Grskovic, M. và Ramalho-Santos, M., The transcriptome pluripotent (October 10, 2008), StemBook, ed. Cộng đồng nghiên cứu tế bào gốc, StemBook, doi / 10. 3824 / stembook. 1. 24. 1, // www. stembook. org. - [1] DirectStemBook Hình 2 Bản sao của các tế bào đa năng. Grskovic, M. và Ramalho-Santos, M., Bản sao đa năng (10 tháng 10 năm 2008), StemBook, ed. Cộng đồng nghiên cứu tế bào gốc, StemBook, doi / 10. 3824 / stembook. 1. 24. 1, (CC BY 3. 0) thông qua Commons Wikimedia