Sự khác biệt giữa cDNA và Thư viện Genomic | cDNA hay Thư viện DNA Genomic
Sự khác biệt chính - cDNA vs Thư viện Genomic
Có hai loại thư viện DNA được xây dựng bởi các nhà khoa học sử dụng các kỹ thuật di truyền. Đó là thư viện cDNA và thư viện Genomic. Sự khác biệt chính giữa cDNA và thư viện Genomic là thư viện cDNA chứa DNA nhân bản được nhân bản của tổng số mRNA của một sinh vật trong khi thư viện DNA genome chứa các mảnh nhân bản của toàn bộ bộ gen của một cơ thể. Thư viện gen của DNA lớn hơn thư viện cDNA.
NỘI DUNG1. Tổng quan và Chênh lệch khác nhau
2. Thư viện cDNA là gì
3. Thư Viện Genomic là gì
4. So sánh Side by Side - cDNA vs Thư viện Genomic
5. Tóm tắt
Thư viện Genomic là gì?
Thư viện gen di truyền là một bộ sưu tập các dòng vô tính mang các đoạn DNA tổng số của một cơ thể. Nó chứa toàn bộ DNA của bộ gen của cơ thể đó, bao gồm các chuỗi mã hoá và không mã hóa. Việc xây dựng một thư viện gen được thực hiện bằng công nghệ DNA tái tổ hợp, sau đó là nhân bản (kỹ thuật di truyền). Có nhiều bước khác nhau liên quan đến việc xây dựng như thể hiện trong hình 01. Quá trình này bắt đầu với sự cô lập ADN của gen. Sử dụng một quy trình chiết xuất ADN thích hợp, DNA gen tổng số của một sinh vật nên được cô lập. Sau đó, ADN phải được chuyển đổi thành các kích cỡ có thể quản lý hoặc vào các đoạn cụ thể bằng các endonucleases hạn chế (các enzyme cắt DNA). DNA bị phân đoạn nên được chèn vào vectơ sử dụng các DNA ligases (các enzyme kết hợp DNA). Một vector là một sinh vật tự tái tạo. Plasmid và bacteriophages thường được sử dụng trong các công nghệ tái tổ hợp ADN. Các vec tơ ligated này được gọi là các phân tử ADN tái tổ hợp vì chúng mang theo cả trình tự ADN riêng và chèn vào. Các vec tơ tái tổ hợp được thêm vào một vi khuẩn chủ và được tạo ra để hấp thụ các vec tơ tái tổ hợp bên trong tế bào vi khuẩn. Vi khuẩn có vectơ tái tổ hợp (plasmid) nên được nuôi cấy trong môi trường nuôi cấy. Trong quá trình nhân vi khuẩn, ADN vi khuẩn, cùng với plasmid tái tổ hợp, sao chép các bộ gen của chúng và tạo ra các dòng vô tính. Những dòng vô tính này chứa toàn bộ bộ gen của sinh vật nguồn. Do đó, nó được gọi là thư viện gen. Plasmid có thể dễ dàng tách ra khỏi DNA nhiễm sắc thể vi khuẩn để xây dựng thư viện bộ gen của sinh vật đó. Nếu một sinh vật đặc biệt chứa các gen quan tâm, nó dễ dàng phát hiện nó trong thư viện gen bằng cách lai bằng các đầu dò phân tử (marker).
Các thư viện di truyền rất quan trọng để nghiên cứu cấu trúc và chức năng của gen, các gen cụ thể, vị trí gen, lập bản đồ gen, đột biến gen, trình tự gen, xác định các gen điều trị mới …
Hình 1: Xây dựng mô hình gen thư viện genomic
Thư viện cDNA là gì?
Thư viện cDNA là một bộ sưu tập các chuỗi DNA bổ sung (cDNA) bổ sung được tổng hợp từ tổng số mRNA của một sinh vật. Thủ tục xây dựng bao gồm các bước khác nhau. Làm sạch tổng số mRNA từ cơ thể là bước đầu tiên có liên quan. Các mRNA cô lập được chuyển đổi thành các sợi cDNA bằng một quá trình gọi là phiên mã ngược. Phép đảo ngược được tạo điều kiện bởi một enzyme gọi là phiên mã ngược. Nó sử dụng một mồi nhỏ 3 'và bắt đầu tổng hợp cDNA cDNA đầu tiên bổ sung cho mRNA khuôn mẫu. Kết quả cDNA đôi được chuyển thành các đoạn nhỏ hơn bằng cách sử dụng endonucleases hạn chế và đưa vào các vectơ thích hợp. Các phân tử tái tổ hợp đã được xây dựng này sau đó được đưa vào cơ thể vật chủ và được nuôi cấy trong môi trường nuôi cấy để tạo ra các dòng vô tính. Việc thu thập các dòng vô tính chứa các mảnh cDNA của một sinh vật được gọi là thư viện cDNA. Toàn bộ mRNA trưởng thành đã lát không chứa intron và các vùng điều tiết. Do đó các mảnh không mã hóa không có trong các thư viện cDNA không giống như trong một thư viện gen.Các thư viện cDNA rất quan trọng cho việc phân tích các vùng mã hoá, các chức năng gen, biểu hiện gen, vv
Hình 2: Xây dựng thư viện cDNA
Sự khác nhau giữa cDNA và Thư viện Genomic là gì?
Thư viện gen là một bộ sưu tập các dòng vô tính có chứa DNA cDNA và thư viện genomic
Thư viện gen là một bộ sưu tập các dòng vô tính mang DNA bổ sung vào mRNA của một sinh vật
DNA gen tổng số của một cơ thể.
Coding vs Noncoding Sequences |
|
| Thư viện cDNA chỉ chứa các trình tự mã hóa; nó không chứa intron. | Thư viện bộ gen bao gồm toàn bộ DNA di truyền bao gồm DNA không mã hóa (intron và quy định). |
| Kích thước | |
| Thư viện cDNA nhỏ. | Thư viện gen là rất lớn. |
| Chất liệu bắt đầu | |
| Vật liệu ban đầu là mRNA | Nguyên liệu ban đầu là DNA. |
| Sự tham gia của việc sao chép ngược. | |
| Sự sao chép ngược xảy ra trong tổng hợp sợi cDNA đầu tiên. | Quá trình sao chép ngược không xảy ra. |
| Tóm tắt - cDNA và Thư viện Genomic | |
| Thư viện gen đại diện cho một quần thể các dòng vô tính mang DNA DNA tổng hợp bị phân mảnh của một cơ thể. Thư viện cDNA đại diện cho số lượng các dòng vô tính mang DNA bổ sung của tổng số mRNA của một cơ thể. Một clone cDNA chỉ chứa các chuỗi tìm thấy trong mRNA, trong khi bản sao gen có chứa các trình tự của toàn bộ bộ gen. Đây là sự khác biệt giữa cDNA và thư viện gen. | Tài liệu tham khảo: |
1. Haneef, Deena T KochunniJazir. "Sự khác biệt giữa thư viện Genomic và cDNA. "Sự khác biệt giữa thư viện Genomic và cDNA. N. p., n. d. Web. 15 tháng 22017
2. Stekel, Dov J., Yoav Git, và Francesco Falciani. "So sánh biểu thức gen từ nhiều thư viện cDNA. "Nghiên cứu gen. Cold Press Harbor Laboratory Press, tháng 12 năm 2000. Web. 16 tháng 2 năm 2017
3. "Màn hình thư viện gen cho các gen tham gia vào khả năng chịu n-butanol trong Escherichia coli. "Màn hình Thư viện Gen cho các gen liên quan đến N-Butanol Tolerance trong Escherichia coli. N. p., n. d. Web. Ngày 16 tháng 2 năm 2017
Hình ảnh được phép:
1. "Thành lập Thư viện cDNA" của Tiến sĩ Dre tại Wikipedia tiếng Anh (CC BY-SA 3. 0) thông qua Commons Wikimedia
2. "Xây dựng Thư Viện Genomic" của Aluquette - Tác phẩm của chính mình (CC BY-SA 3. 0) qua Commons Wikimedia
